Разное ранжирование в регионах

Всем привет!
Проблема, которая уже давно беспокоит.
Предположим, у вас есть сайт на 3 региона.

1. Нижний Новгород
2. Казань
3. Москва и Московская область

В регионе 1 хороший трафик. В Вебмастере именно этот регион "Городской округ Нижний Новгород, Нижегородская область, Приволжский федеральный округ, Россия".

В регионе 2 трафика почти нет. Примерно 5-7% от региона 1. Он указан в справочнике. В тексте страниц регион встречается. Указан в title и мета-описании.

В регионе 3 трафик есть, но не так много. Возможно из-за конкуренции. Примерно 50% от региона 1. Он указан в справочнике. В тексте страниц регион встречается. Указан в title и мета-описании.

Пожаловался в Яндекс, на что ответили: "В разных регионах используются разные алгоритмы ранжирования. Все это может приводить к тому, что по одинаковым запросам сайты занимают в разных регионах разные позиции."

Причем изначально, когда был выбор между сайтами на поддоменах или "три в одном", Яндекс при наличии одного и того же каталога рекомендовал второй вариант. Так и сделали.

Что делать-то? Региональные ссылки? Или поддомены? Или отдельные домены? Причем продвижение в Казани особенно актуально.